婚礼过后一个月，自来也老师已经离开了木叶，向着大蛤蟆仙人的预言前进了，之后夜无忌设计的婚纱礼服也被那个幸福起点看重，由于阿诗玛和夕日红的关系，夜无忌也就放弃了一些利益和幸福起点合作了。
因为战争已经结束，不过战争带来的各种问题也陆续的出现了，首先就是换火影的呼声，越来越大了。一些传言都是在说三代火影的软弱，才造成了其他四国陆续攻击木叶，也就是说这次战争，三代火影要负主要责任，夜无忌当然也听到了一些传言，虽然不知道源头，不过夜无忌猜也知道是团藏干的，不过团藏的目的，夜无忌却不清楚，因为不管怎么样，团藏都没有可能当选四代火影的，目前四代火影呼声最高的就是水门了，当然偶尔还有提及夜无忌的声音。
果然一次公开的场合，三代火影提到了火影的接任问题，理由是他已经太老了，让下面的提名谁当四代火影，不过三代火影的提名是水门。
也就是这个时候，夜无忌知道了火影的选举方式，一是上代火影的提名，这点很重要，基本上上一代火影提名谁的话，那他就是火影了，像纲手在佩恩攻击木叶的时候，昏迷来不及提名，从而让团藏上位，严格的说起来，那次根本就不算数的，也就是因为木叶被佩恩摧毁，才造成那样的情况。
不过上一代火影提名，也只是第一步而已，下一步就是木叶的上忍投票，这点才是最重要的，因为如果上忍投票这一关没过的话，会打回去重来一次的，三次投票不过的话，火影你就没有希望了。
至于后面的征求火之国大名的意见，严格的说只是过场而已，不说木叶了，各国选举的火影，其国家的大名，基本上都是同意的，至于火之国的大名的意见，占有一点分量，是因为火之国大名有着自己的势力，就是守护十二忍，火之国除了木叶之外，还有别的忍者势力，像地陆所在的火之寺，还有其他的一些小忍者家族，守护十二忍除了一个阿诗玛以外，其他的都是木叶以外的忍者势力，这才让火之国的大名有了一些说话的权利，至于其他的四国，大名的势力要弱很多。
至于更后面的平民选举，更夜无忌的前世一样，过场中的过场。木叶的平民之所以比其他四国的平民看起来地位高不少，是因为有两个平民代表在当长老，就是三代火影的队友，水户门炎和转寝小春，这个两个长老是平民出身，当年实力也是不错的，当然没有三代火影还有团藏厉害，不过当时能被二代火影看重，肯定有着厉害的一面。
现在三代火影提名水门当四代火影，下一步就是上忍投票了，木叶的上忍那么多，当然不可能都召集回来投票，更何况还有的人在外做任务呢，这个时候就是上忍班的意见最重要了，以木叶各家族为代表，加上平民出身的上忍组成的上忍班，就是木叶的中坚团体，而上忍班的班长就是奈良一族的人，也就是现在鹿丸的爷爷，鹿久的父亲。
而猪鹿蝶一向都是猿飞一族的忠实手下，所以这一关，毫无悬念的过去了，最后就是三代火影修书给火之国的大名，等到火之国大名的回信后，水门就是四代火影了。
一周后，今天所有在木叶的闲置忍者，还有各个家族都派人来到了火影大楼的前面广场处，因为火影大楼上面正在举行火影的接任仪式，夜无忌也从自己的实验室里走了出来，夜无忌在婚礼后，根本就没有怎么露面，同样的木叶医院也没有去上班，虽然也有一些闲言闲语说夜无忌是因为竞争四代火影失败，不好意思出来见人，夜无忌在听到后也就是一笑了之，因为夜无忌最近在研究初代火影的细胞，然后才好移植初代火影的细胞，穿越到火影世界，没有血继限界，夜无忌虽然不在意，可还是有些失落的。至于那些误会的话，更是让夜无忌开心，因为这样就没有什么人关注他了，同样的他不木叶医院上班，三代火影也没有怎么管。
本来夜无忌还有一件事情要做的，那就是教鼬这个徒弟，可惜这段时间，鼬被他那老爸宇智波富岳给带走了，不在木叶村，夜无忌也就没有去教。
今天要不是为了见证水门接任四代火影的仪式，夜无忌还不准备露面呢。
在水门半跪在三代火影的面前，从三代火影的手里接过火影斗笠，并且戴到头上的时候，夜无忌第一个发出了欢呼声，虽然其他的人奇怪的看了他一眼，不过随后也发出了欢呼声。
接着就是水门的就职宣言了，然后就是水门作为四代火影陆续的接待了木叶各家族的人，还有各个方面的代表，其中火之国大名派出的代表，同样砂忍村也派了代表过来祝贺着。
三天后，火影大楼的顶层，夜无忌和水门并肩而立，从火影大楼上看着远处的火影岩。
“最近你都没怎么出现，要不是在我接任火影的仪式上，你出现了一次，我还以为你真的因为四代火影的事情，而有些想不开呢。”水门穿着火影袍，对着夜无忌说道。
“做了样子而已，给有心人看的，而且我有些东西要研究，对了水门哥，现在是四代火影大人了，现在你接任了所有的火影权利了吗”夜无忌笑着说道。
“还没有，只是接掌了一部分，怎么你有事。”水门听到夜无忌的话后，眼神闪了一下，感到有些意外。
“暗部接掌了吗。”夜无忌问道。
“接了一部分，卡卡西被我安排在暗部里去了，你问这些干什么。”水门有些奇怪的说道。
“给我一部分暗部的权利吧。”夜无忌直接要求到。
“木叶医院你不管了吗，我还想着现在纲手大人不在，木叶医院让你掌握呢，怎么你喜欢暗部的生活吗。”水门更好奇了。
“我可不喜欢暗部的生活，我喜欢什么样的生活水门哥你应该清楚，我这个人可是很懒的，可是现在却没法懒起来啊。”夜无忌对着火影岩笑着说道。
“恩，你发现了什么。”水门的目光一凝，有些凝重的说道。
“呢，自来也老师还有三个徒弟，水门哥你应该知道吧。”夜无忌随口问道。
“恩，老师说过这件事，他们怎么了。出事了吗”水门说道。
“自来也老师有说过他们其中之一拥有轮回眼的事情吗”夜无忌问道。
“老师提过，同时老师也说起了大蛤蟆仙人的预言，说他可能是预言之子，所以除了老师和我，在木叶就没有人知道轮回眼这件事情了，毕竟是六道仙人的眼睛，为了防止别人打他的主意，不过你提起这个干什么。”水门问道。
“我在鬼之国养伤的时候，得到鬼之国的允许看了一些鬼之国的资料，虽然资料不怎么全，不过我还是发现了一个很有意思的事情。”夜无忌嘴角笑了笑，把事情推倒鬼之国的身上，这是夜无忌事先想好的借口。
“哦，是什么事情。”水门也有些好奇夜无忌到底发现了什么。
“结合鬼之国的资料，还有我的一些发现，水门哥，那个拥有轮回眼的人是长门，而他的一系列特征表示他和玖辛奈姐是同一族人，也是说他是漩涡一族的后裔，而鬼之国的那个资料记载的却是，轮回眼是从写轮眼进化后产生的，虽然那个资料记载的不完全，不过关于轮回眼的先决条件确实拥有写轮眼这点是没有错的，至于后面写轮眼怎么变化成轮回眼却没有记载。而长门是漩涡一族的族人，从这点来看他是绝对不可能拥有写轮眼的，而没有写轮眼，那么就不可能拥有轮回眼，那么从这点来看，那么长门的轮回眼就是别人的了，那么这个人把轮回眼放到长门身上，是什么意思呢”夜无忌说道这，就停止不说了。
水门听到夜无忌的话后，沉默了良久，才开口说道，“你确定轮回眼是写轮眼进化出来的。”
“如果鬼之国的资料没错的话，那么是确定的，而且我在鬼之国还看了一些别的东西，他们那里封印的魔物，好像也是六道那个时代流传下来的，这么说起来，他们知道一些六道轮回眼的事情也是很正常的。”夜无忌如此说道。
“这样啊，那么你要暗部是因为这事了。”水门说道。
“恩，我想调查一些事情，同时这次的战争，水门哥你不觉得有些不对吗，虽然我在木叶就这几年，不过木叶有这么遭人恨吗，其他的四国都进攻木叶，而且还是按照顺序来的，如果他们真的想进攻木叶，为什么不联手同时发动呢，而且各国对木叶发动战争的理由都有些奇怪，起码砂忍的风影应该不是木叶人杀的吧，可他们的影确实失踪了，能够不知不觉的杀了一国之影，不管是围攻，还是暗害，都应该是很厉害的人物，也许有一个黑暗的组织在暗处搞事呢。”夜无忌慢慢的把自己知道的事情当做猜想，告诉了水门，现在水门是四代火影，所以有很多的事情，都可以做了。
“这样啊。”水门考虑了一下，然后开口说道，“现在的暗部我也只是掌握了一部分，其他的权利还是三代大人那里，这样吧，我先给你一个暗部中队长的权利，同时你把这些人转为暗处吧，看看能不能找到什么情报。”暗部一队和普通的上忍带队都是一样的，是四个人，而一个中队，就是十组暗部小队，而一个暗部大队则是十组暗部中队，最后十个暗部大队就是木叶的整个暗部了，当然这是暗部正式的编制，没有把跟的人算上。也就是现在的夜无忌有了暗部四十个手下了。
“那个水门哥，我可以看看木叶的封印之书吗，我想里面应该有不少忍术吧。“夜无忌又开口说道。
“恩，我和三代商量一下，以你的功绩，这点是没有问题的，那么木叶的医院你现在是不想管了。”水门说道。
“我还是做我的副院长吧，至于院长你还是给他们吧，现在我的首要任务就是提升实力，不好意思，水门哥，最近几年我可能不会出任务了。”夜无忌对着水门说道。
“恩，没问题，你做好自己的事情吧，对了，关于那个组织的猜想，你调查的时候小心一点。”水门说道。
“放心好了，对了水门哥，我们制造一些谣言吧，说我和你不和，也许他们会找上门来也说不定。”夜无忌建议道。
“没那个必要，这件事情我会处理的，你就不要冒险了。”水门拒绝了夜无忌的要求。
“恩我知道了。多谢水门哥的关心。”夜无忌笑着说道。
后面正式剧情了，国庆断更，不好意思，祝各位国庆快乐。