理清楚了源头后，朱由检问群臣道：
“祝枝山《野记》不可信，李贤的《天顺日录》可信吗？”
群臣哑口无言，没有人为李贤说话。
尤其是《天顺日录》对景泰皇帝多有诋毁之处，被正直的大臣很看不起。
之前评选紫阁功臣时，李贤就被皇帝和群臣认定道德败坏。如今景泰皇帝都被当今皇帝上庙号了，自然更没有人为他辩解。
朱由检见群臣如此表现，当即就下令道：
“《天顺日录》同样应该禁毁，引用它的图书，也要全部查禁。”
“李贤在永乐六年出生，他对方孝孺的记载，已多有讹传之处。”
“更晚出生的人，又有多少可信呢？”
“刘先生编撰方孝孺传，一定要注明史料来源，不要把以讹传讹的内容加进去。”
这个命令下达后，群臣一时哗然，知道若是按这个命令执行，有关方孝孺的图书，基本要全部覆没。
这让他们觉得难以接受，很多人纷纷进言，认为不应当因为这一点，就查禁所有图书。
朱由检见到这个情况，怒气勃发地道：
“不查禁这些书籍，难道要让诽谤的文字流传天下吗？”
“建文之事，本来早有定论。”
“但是自《天顺日录》流传以来，却出现了异议。”
“尤其是诛十族之事，被祝枝山《野记》编造出来后，竟然堂而皇之地出现在《皇明通纪》等私修史书上，让一些不学无术的文人，对此信以为真。”
“这样的书籍不查禁，难道要让它继续误导世人吗？”
“成祖在世间的形象，就是被这些人败坏！”
忿怒地骂了诋毁成祖的人一通，朱由检又拿着《野记》骂道：
“还有这个编造诛十族的祝枝山，难道就不通礼法吗？”
“他只知道十比九大，却不知道相比诛九族，更严重的是诛三族。”
“刘先生你来说说，九族和三族都有哪些。”
刘宗周一向推崇方孝孺，此时见方孝孺被诛十族、甚至夷族都被皇帝否认，精神也受到了冲击。
不过面对皇帝的问题，他还是收拾心情答道：
“九族者，上至高祖，下及玄孙，皆是同姓之人。《大明会典》有本宗九族五服正服之图。”
“三族者，父族、母族、妻族。秦汉之法酷烈，有夷三族之令。”
“国初尚书夏恕尝引汉法，请著律，反者夷三族。”
“太祖以为此法太重，故而没有实施。”
“《大明律》所定谋反大逆律，株连祖父、父、子、孙、兄弟五族及伯叔父兄弟之子，年十六以上者。”
“故而本朝实无被夷九族者，被夷三族者唯有卓敬。”
卓敬也是建文臣子，朱由检听到这个名字，怒气渐渐缓了下来，询问道：
“卓敬被夷的三族，是父族、母族、妻族，还是父、子、孙三族？”
“为何世间流传的，是方家被杀者最多？”
这个并没有人深究，因为卓敬的名气，远远不如方孝孺。
再说卓敬在万历年间就被表墓建祠，已经实际平反了。自然更没人提他，为他叫什么屈。
见到群臣无人回答，朱由检道：
“有关卓敬被夷三族之事一定要查清楚，不要胡乱讹传。”
“昔年成祖也曾说：国家养士三十年，惟得一卓敬。”
“他是一个有才能的忠臣，成祖对杀他很后悔。”
又因为卓敬已经被表墓建祠，朱由检下令道：
“卓敬是忠臣，应该建祠表彰，礼部要追赠谥号，给于应有待遇。”
“大明无夷三族之律，若是他有后人存在，朕当封爵补偿。”
这个态度，让为建文君臣翻案的臣子，心情陡然一松。
因为皇帝这个态度，明显还是要为建文君臣翻案的，只是对一些讹传的事情不认可。
礼部尚书温体仁这时也明白了皇帝的想法，主动出言说道：
“方孝孺同样是忠臣，但是被诛十族之事，却是子虚乌有。”
“臣以为当正本清源之后，再为方孝孺追谥。”
朱由检点头认可，他知道自己必须妥协。
方孝孺在民间的影响力很大，包括刘宗周等人，都称赞他的节义。
如果不追赠他，建文君臣的事就会没完没了，永远不会停歇。
所以他才决定正本清源，把事情明明白白地说出来。
就算是承认成祖杀戮太过，也好过任由诛十族流传。
必须让官方正史占据主流，避免野史流传，变得越来越野。
怀着这个想法，朱由检道：
“方孝孺的事情，要明明白白理清。”
“待到查清楚后，彻底做出结论。”
“成祖当时的株连，或有滥用刑罚之处。”
“方孝孺的后人如能确认谱系，朕当封爵补偿。”
“他和卓敬一样，都是建文君的忠臣。”
这个态度，让刚才凝重的氛围，更加轻松起来。
刘宗周请求道：
“诛十族的事情，虽然子虚乌有。”
“但是相关图书，却不能一概查禁。”
“臣以为可由朝廷修订，用新出版的图书，代替有错误的旧版。”
朱由检点头认可，知道查禁所有涉及方孝孺的图书，阻力会大到根本无法实行。
所以他下令道：
“有关方孝孺等建文君臣的图书和文章，以后要以官方正史为准。”
“凡是与此抵牾者，应当尽皆修订，否则不准流传。”
“有擅自编造事迹流传者，追夺出身以来文字，审订所有图书，本人流放海外。”
“例如李贤、祝枝山这两个编造事迹的始作俑者，都要追夺出身和封赠，所著图书都要修改后才能流传。”
这个惩罚，相比之前的完全查禁松了一些，却仍让很多人心惊。
尤其是对李贤和祝枝山的惩罚，在大明前所未有，让一些文人皱眉，本能地就要劝谏。
不过朱由检却不给他们说话的机会，盯着资政大臣朱国祯道：
“《三朝要典》之中，崔呈秀曾说‘大狱未遂，《涌幢小品》先刊，此东林所由起于诡遇，盛于标榜’。”
“如今《三朝要典》正在重新编撰，《涌幢小品》有什么说法呢？”
“朱卿你来说说！”
《涌幢小品》是朱国祯的作品，是在天启年间出版的，被阉党借题发挥。
朱国祯听到皇帝引用阉党崔呈秀的言语，还把自己《涌幢小品》和《三朝要典》相提并论，一时怒气勃发，忍不住就要争辩。
但是韩却抢先道：
“此书是朱学士一人编撰，收录典故野史，或有不当之处。”
“臣以为当让国史馆修订，然后重新出版。”
这让朱国祯宛如被浇了一盆凉水，认识到当前的形势。
如果他不管不顾在这点上争辩，说不定就会再起党争，韩这个即将上位的东林党首辅都会受到牵连。
其余东林党人也同样察觉到这一点，明白了韩抢着出言的原因。
实在是此时不宜掀起党争，不能让朝堂上再起波澜。
朱由检之所以选在此时给建文君臣做结论，也有逼迫东林党认同的意味。
若是东林党连这点都不配合，那就别想在朝中掌大权。
对韩的识趣，朱由检非常满意，微微点头说道：
“《涌幢小品》确有不当之处，应当修订完善。”
“例如书中《族刑》一节，说什么‘战国而后，有三族、五族、九族之刑。国朝乃十族’，分明就是讹传。”
“本朝谋反大逆尚且只诛五族，何来十族之说？”
“难道你们都嫌《大明律》太轻，要学夏恕定得严酷些？”
这话说得朱国祯头上冒汗，群臣也不敢胡言乱语。
生怕皇帝在重制礼乐修订法律时，把九族、十族的刑罚加进去。
朱国祯这个时候，已经在庆幸自己奉诏回到朝廷修国史了。
因为不但《涌幢小品》有十族之说，他私下修的《皇明史概》，也收录了诛十族的事情，
按照当今皇帝定的条例，他多半会因此受罚，甚至牵连到其它书籍。
好在《皇明史概》还没刊印，他如今又是资政大臣，皇帝留了体面。
只要把这些相关内容给修改了，仍不影响流传。
想清楚这点的朱国祯，对韩都不由有些感激了，因为他现在就在国史馆任职，自己的书自己就能改。
他此时已经决定，要把自己著作的图书全部查阅一遍，把诛十族、夷九族之类的文字全部修改。免得以后被人发现，影响出身封赠。
――
彻底否认了诛十族的说法，并禁止其流传，朱由检继续说道：
“建文君臣之事，世间多有讹传，朝廷需正本清源，编撰一部正史。”
“国史馆要担起这个任务，务必编撰出让世人认可的信史。”
“这部书的名字，就定为《靖难实录》，记录建文君臣，和成祖靖难的事迹。”
这个命令，再次让群臣哗然。
刑部主事李若愚道：
“建文在位四年，敬天爱民，崇儒纳谏，无一失德事。祗因误用汉削七国计以及于难，悲夫。”
“臣以为建文年号不可不复也，建文庙谥不可不补也，逊国诸死节臣不可不录也。”
“《靖难实录》，当为《建文实录》，以正建文名号。”
朱由检对于此言极为不适，反问道：
“建文君若是无一失德事，那么湘王因何而死，周王、代王、齐王、岷王又为何被问罪甚至削爵？”
“成祖起兵靖难，在你看来是毫无道理吗？”
李若愚哑然无言，不敢否定靖难的正当性。
否则就是否认了成祖，以及成祖之后的大明皇帝。
即使他不认为建文失德，也只能够憋着。
转而拿成祖的做法说事，回应道：
“成祖定鼎之后，问朝臣葬，建文学士王景言：宜用天子礼。”
“成祖特从其议，可见成祖也是承认建文皇帝。”
这个确有其事，朱由检也不否认，说道：
“建文君确实曾是皇帝，所以成祖以天子礼节安葬。”
“但他失德乱政，却又不堪为帝。”
“所以无有庙谥，只称其为建文君。”
说着，他又忽然提到了一个话题，问群臣道：
“昔年太祖崩逝时，若是没有立下太孙，按礼法应当由谁继承皇位？”
礼部尚书温体仁揣摩上意，回答道：
“立嫡以长不以贤，立子以贵不以长。”
“太祖崩逝之时，太祖长子懿文太子已逝，次子秦王、三子晋王同样已经离世。”
“成祖为诸王之中最长者，又是孝慈高皇后嫡子，按礼法当由成祖继位。”
这个说法，自然有人不同意，太常寺卿、礼部右侍郎李标道：
“嫡长之制，不止有嫡子，尚且还有嫡孙。”
“《唐律疏议》有云：王、公、侯、伯、子、男，皆子孙承嫡者传袭。无嫡子，立嫡孙；无嫡孙，以次立嫡子同母弟；无母弟，立庶子；无庶子，立嫡孙同母弟；无母弟，立庶孙。曾、玄以下准此。”
“太祖崩逝之时，当由嫡孙建文君继位。”
温体仁反驳他道：
“《唐律疏议》所说的嫡孙，是指嫡长孙。”
“太祖嫡长孙是虞怀王朱雄英，而非其弟朱允。”
“嫡子同母弟高于嫡孙同母弟，故而若是太祖没有立朱允为太孙，当由成祖继位。”
“成祖继承皇位，符合嫡长之制！”
这个说法，让很多臣子绷不住，吏部右侍郎李若星道：
“《唐律疏议》是唐制，本朝自有制度。”
“《皇明祖训》曰：凡朝廷无皇子，必兄终弟及。”
“只有在没有皇子的情况下，才能由其他支脉承袭。”
“建文君为懿文太子之子，朝廷在有皇子的情况下，自然不用兄终弟及。”
“建文君又在懿文太子诸子中最长，故当继承皇位。”
温体仁这下有些无法回答，朱由检接替他道：
“建文君朱允是虞怀王朱雄英继母弟，他的继承顺序，和虞怀王同母弟朱允孰先？”
这个问题，让群臣议论纷纷。
因为这是礼法的一个漏洞，历代说法不一。
根据《吕氏春秋》记载，纣王有同母兄长二人，但他们都是纣王的母亲在做妾室时生下的，身份一直是庶子。纣王是在他母亲扶正为妻子后生下的，身份是嫡子，所以继承王位。
《吕氏春秋》对此的评价，是“用法若此，不若无法”。商朝之后的朝代，没有延续这个办法。妾室在扶正后，庶子也变得可以升嫡。
但是这就带来一个问题，如果庶子的年龄长于嫡子，他在升为嫡子后，继承顺序是否就高于元配生下的嫡子呢？
朱允和朱允之间，就是这个争议。